Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda udaljenosti

Sažetak na hrvatskom: Izgradnja filogenetskog stabla kreće izračunom matrice udaljenosti. Udaljenosti se računaju po Jukes - Cantorovom modelu tako da se kao ulaz programa predaju poravnati genomi ili proteinski lanci u FASTA formatu. Nakon što je iz ulazne datoteke kreirana matrica udaljenosti, na...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:48562/Details
Glavni autor: Gajski, Nikola (-)
Ostali autori: Domazet-Lošo, Mirjana (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, N. Gajski, 2017.
Predmet:
LEADER 01966na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2017 ci ||||| m||| 00| 0 hr d
035 |a (HR-ZaFER)ferid5741 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Gajski, Nikola 
245 1 0 |a Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda udaljenosti :  |b završni rad /  |c Nikola Gajski ; [mentor Mirjana Domazet-Lošo]. 
246 1 |a Distance-Based Phylogenetic Tree Construction Methods  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b N. Gajski,  |c 2017. 
300 |a 44 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b preddiplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Programsko inženjerstvo i informacijski sustavi, šifra smjera: 39, datum predaje: 2017-06-09, datum završetka: 2017-07-10 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Izgradnja filogenetskog stabla kreće izračunom matrice udaljenosti. Udaljenosti se računaju po Jukes - Cantorovom modelu tako da se kao ulaz programa predaju poravnati genomi ili proteinski lanci u FASTA formatu. Nakon što je iz ulazne datoteke kreirana matrica udaljenosti, na temelju tih udaljenosti programska potpora omogućuje prikaz: matrice udaljenosti, filogenetskog stabla izgrađenog UPGMA metodom ili stabla izgrađenog metodom povezivanja susjeda. 
520 3 |a Sažetak na engleskom: Phylogenetic tree construction starts with computation of the distance matrix. Distances are based on Juke – Cantor’s model of evolution. Input of the program are aligned genomes or protein sequences in FASTA format. When the distance matrix is computed, the program will construct phylogenetic tree using UPGMA algorithm or neighbor joining method. 
653 1 |a filogenetsko stablo  |a UGPMA  |a metoda povezivanja susjeda  |a matrica udaljenosti  |a genom  |a protein  |a takson 
653 1 |a phylogenetic tree  |a UGPMA  |a neighbor joining method  |a distance matrix  |a gene  |a protein  |a taxon 
700 1 |a Domazet-Lošo, Mirjana  |4 ths 
942 |c Z 
999 |c 48562  |d 48562