Analiza molekularnog potpisa tumora uz pomoć strojnog učenja

Sažetak na hrvatskom: U uvodnim poglavljima izložena je motivacija problema. Kratko su opisani biološki koncepti čije je poznavanje važno u kasnijim fazama. Glavna tema rada je razvoj generičkog klasifikatora. Naglasak se stavlja na mogućnost određivanja tipova i podtipova tumorskih stanica. U inkre...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:48771/Details
Glavni autor: Jukić, Josip (-)
Ostali autori: Jakobović, Domagoj (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, J. Jukić, 2018.
Predmet:
LEADER 02731na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2018 ci ||||| m||| 00| 0 hr d
035 |a (HR-ZaFER)ferid6160 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Jukić, Josip 
245 1 0 |a Analiza molekularnog potpisa tumora uz pomoć strojnog učenja :  |b završni rad /  |c Josip Jukić ; [mentor Domagoj Jakobović]. 
246 1 |a Analysis of molecular signature of tumors with machine learning  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b J. Jukić,  |c 2018. 
300 |a 35 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b preddiplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 41, datum predaje: 2018-06-15, datum završetka: 2018-07-13 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: U uvodnim poglavljima izložena je motivacija problema. Kratko su opisani biološki koncepti čije je poznavanje važno u kasnijim fazama. Glavna tema rada je razvoj generičkog klasifikatora. Naglasak se stavlja na mogućnost određivanja tipova i podtipova tumorskih stanica. U inkrementalnom postupku razvoja koristi se algoritam stroja potpornih vektora (SVM). Prikazan je način optimizacije parametara SVM-a uz pomoć genetskog algoritma. Opisana je implementirana paralelizacija posla pri učenju. Izgrađeni klasifikator ispitan je na različitim vrstama skupova podataka. Ukratko su opisane strategije višerazredne klasifikacije. Predstavljen je način procjene vjerojatnosti pripadnosti uzoraka pojedinim razredima klasifikacije u vidu Plattovog skaliranja. Izloženi su rezultati i uspješnost konačnog modela. 
520 3 |a Sažetak na engleskom: Motivation for this assignment’s problem is presented in introductory chapters. Biological concepts, key to understanding later work, are briefly described. Main topic in this assignment is development of generic classifier. Emphasis is put on possibility of determining types and subtypes of tumor cells. Algorithm Support Vector Machine is used in incremental building procedure. Optimization of SVM’s parameters with genetic algorithm is described thoroughly. Implementation of parallel computing for work needed for training is also presented. Built classifier is tested on various types of datasets. Strategies of multiclass classification are shortly described. A way of creating a probability of class association approximation is shown by method of Platt scaling. Results and achievements of final model are stated in the end. 
653 1 |a klasifikacija  |a jezgrene funkcije  |a genetski algoritam  |a tumorske stanice 
653 1 |a classification  |a kernel functions  |a genetic algorithm  |a tumor cells 
700 1 |a Jakobović, Domagoj  |4 ths 
942 |c Z 
999 |c 48771  |d 48771