Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije

Sažetak na hrvatskom: Brza i jeftina analiza metagenomskog uzorka korisna je za kontrolu kvalitete hrane, dijagnozu bolesti i utvrd̄ivanje štetnih nametnika na biljkama. Tradicionalne labora- torijske metode su ili dugotrajne ili namijenjene za samo jednu vrstu. Korištenjem ured̄aja treće generacije...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:49951/Details
Glavni autor: Rupe, Marina (-)
Ostali autori: Šikić, Mile (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, M. Rupe, 2017.
Predmet:
LEADER 02518na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2017 ci ||||| m||| 00| 0 hr d
035 |a (HR-ZaFER)ferid5672 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Rupe, Marina 
245 1 0 |a Analiza metagenomskog uzorka dobivenog sekvenciranjem koristeći uređaje treće generacije :  |b završni rad /  |c Marina Rupe ; [mentor Mile Šikić]. 
246 1 |a Analysis of a Metagenomic Sample Obtained by Third Generation Sequencing Technology  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b M. Rupe,  |c 2017. 
300 |a 26 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b preddiplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 41, datum predaje: 2017-06-09, datum završetka: 2017-07-10 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Brza i jeftina analiza metagenomskog uzorka korisna je za kontrolu kvalitete hrane, dijagnozu bolesti i utvrd̄ivanje štetnih nametnika na biljkama. Tradicionalne labora- torijske metode su ili dugotrajne ili namijenjene za samo jednu vrstu. Korištenjem ured̄aja treće generacije dobivaju se očitanja koja su puno dulja, no sadrže i znatno veći postotak pogrešaka. Implementiran je alat koji utvrd̄uje koji su organizmi prisutni u metagenomskim uzorcima dobivenenima koristeći upravo ured̄aje treće generacije. Alat u prvom koraku pronalazi sve organizme čiji genetski materijal nalikuje očita- njima iz uzorka, a zatim u drugom koraku analizira rezultate iz prvog koraka i utvrd̄uje koji su organizmi prisutni u zadanom uzorku. 
520 3 |a Sažetak na engleskom: A fast and inexpensive analysis of metagenomic samples is useful for food quality control, medical diagnosis and identifying harmful plant parasites. Traditional labo- ratory methods are either time-consuming or designed for a specific species. Third- generation devices produce reads that are much longer, but also have a significantly higher error rate. A tool is implemented to determine which organisms are present in metagenomic samples obtained via third-generation devices. In its first step, the tool finds all organisms whose genetic material resembles that of the sample’s reads. Af- terwards, in the second step, the tool analyzes the first step’s results and determines which organisms are present in the given sample. 
653 1 |a metagenomika  |a patogeni, dijagnostika 
653 1 |a metagenomics  |a pathogens  |a diagnostics 
700 1 |a Šikić, Mile  |4 ths 
942 |c Z 
999 |c 49951  |d 49951