Algoritam straničenja velike baze podataka genoma

Sažetak na hrvatskom: Straničenje velike baze podataka se odvija u dva koraka. Prvi je podjela baze podataka na manje cjeline (baze podataka manjeg memorijskog kapaciteta). On je ostvaren pomoću bash skripte koja, uz sqlite3 naredbe, uspijeva napraviti kostur originalne baze te SQL upite za punjenje...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:50133/Details
Glavni autor: Stjepanović, Mateo (-)
Ostali autori: Domazet-Lošo, Mirjana (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, M. Stjepanović, 2017.
Predmet:
LEADER 02170na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2017 ci ||||| m||| 00| 0 hr d
035 |a (HR-ZaFER)ferid6086 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Stjepanović, Mateo 
245 1 0 |a Algoritam straničenja velike baze podataka genoma :  |b završni rad /  |c Mateo Stjepanović ; [mentor Mirjana Domazet-Lošo]. 
246 1 |a Algorithm for Paging Large-Scale Genome Database  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b M. Stjepanović,  |c 2017. 
300 |a 25 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b preddiplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 41, datum predaje: 2017-06-09, datum završetka: 2017-07-10 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Straničenje velike baze podataka se odvija u dva koraka. Prvi je podjela baze podataka na manje cjeline (baze podataka manjeg memorijskog kapaciteta). On je ostvaren pomoću bash skripte koja, uz sqlite3 naredbe, uspijeva napraviti kostur originalne baze te SQL upite za punjenje baze podacima. Drugi korak je samo straničenje koje iterira po svim bazama te traži podatak koji želimo obraditi. Za nastavak i poboljšanje straničenja može se uvesti lista indeksa baza podataka te se jednostavnim pretraživanjem liste može utvrditi samo jedna baza podataka koju trebamo učitati. 
520 3 |a Sažetak na engleskom: Paging of a large-scale database is done in two steps. The first one is splitting a database into smaller units (databases that contain less memory). It is done by a bash script that manages to create a skeleton of the original database, and to fill the databases with data. The second step is paging itself that iterates over the all databases and searches the data that we want to process. For paging one can use an index list and, by simple search of the list, one can determine only the database that needs to be loaded . 
653 1 |a straničenje, baza podataka, Kraken, metagenom, k-mer, LCA, minimizer 
653 1 |a paging, database, Kraken, metagenom, k-mer, LCA, minimizer 
700 1 |a Domazet-Lošo, Mirjana  |4 ths 
942 |c Z 
999 |c 50133  |d 50133