|
|
|
|
LEADER |
02052na a2200229 4500 |
003 |
HR-ZaFER |
008 |
160221s2016 ci ||||| m||| 00| 0 hr d |
035 |
|
|
|a (HR-ZaFER)ferid4040
|
040 |
|
|
|a HR-ZaFER
|b hrv
|c HR-ZaFER
|e ppiak
|
100 |
1 |
|
|a Široki, Tin
|
245 |
1 |
0 |
|a Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma :
|b završni rad /
|c Tin Široki ; [mentor Mirjana Domazet-Lošo].
|
246 |
1 |
|
|a Finding overlapping reads for de novo genome assembly
|i Naslov na engleskom:
|
260 |
|
|
|a Zagreb,
|b T. Široki,
|c 2016.
|
300 |
|
|
|a 40 str. ;
|c 30 cm +
|e CD-ROM
|
502 |
|
|
|b preddiplomski studij
|c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu
|g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 41, datum predaje: 2016-06-17, datum završetka: 2016-07-11
|
520 |
3 |
|
|a Sažetak na hrvatskom: Određivanje preklapanja je prvi korak de novo sastavljanja genoma metodom preklapanje-razmještaj-konsenzus . Za određivanje preklapanja koristio sam kombinirani pristup. Pristup koristi prošireno sufiksno polje za pronalazak identičnih preklapanja i dinamičko programiranje za poravnanje dijelova očitanja između identičnih preklapanja. Ovakav način određivanja preklapanja omogućava kompromis između kvalitete određenih preklapanja i vremena izvođenja.
|
520 |
3 |
|
|a Sažetak na engleskom: Finding overlaps is the first step of de novo genome assembly using Overlap-Layout-Consensus method. To determine overlaps I used a combined approach. The approach uses enhanced suffix array for finding identical overlaps and dynamic programming to align parts of reads between identical overlaps. This method allows a trade off between the quality of determined overlaps and runtime.
|
653 |
|
1 |
|a određivanje preklapanja, metoda preklapanje-razmještaj-konsenzus
|a sastavljanje genoma
|a prošireno sufiksno polje
|a dinamičko programiranje
|
653 |
|
1 |
|a finding overlaps, overlap-layout.consensus method
|a genome assembly
|a enhanced suffix array
|a dynamic programming
|
700 |
1 |
|
|a Domazet-Lošo, Mirjana
|4 ths
|
942 |
|
|
|c Z
|
999 |
|
|
|c 50279
|d 50279
|