Identifikacija tipova 1D-signala pomoću nenadziranog dubokog učenja

Sažetak na hrvatskom: Tijekom de novo procesa sastavljanja genoma određene tipovi očitanja mogu uzrokovati probleme prilikom rekonstrukcije genoma. Cilj ovog rada je naučiti više o mogućim tipovima očitanja te kako klasificirati očitanja koristeći nenadzirano učenje. Koristeći preklapanja među očita...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:50336/Details
Glavni autor: Tomljanović, Jan (-)
Ostali autori: Šikić, Mile (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, J. Tomljanović, 2017.
Predmet:
LEADER 02605na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2017 ci ||||| m||| 00| 0 en d
035 |a (HR-ZaFER)ferid5181 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Tomljanović, Jan 
245 1 0 |a Identifikacija tipova 1D-signala pomoću nenadziranog dubokog učenja :  |b diplomski rad /  |c Jan Tomljanović ; [mentor Mile Šikić]. 
246 1 |a Identification of 1D-Signal Types Using Unsupervised Deep Learning  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b J. Tomljanović,  |c 2017. 
300 |a 58 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b diplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 56, datum predaje: 2017-06-29, datum završetka: 2017-07-10 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Tijekom de novo procesa sastavljanja genoma određene tipovi očitanja mogu uzrokovati probleme prilikom rekonstrukcije genoma. Cilj ovog rada je naučiti više o mogućim tipovima očitanja te kako klasificirati očitanja koristeći nenadzirano učenje. Koristeći preklapanja među očitanjima, za svako očitanje generiran je graf pokrivenosti i oni su dalje analizirani. Autoenkoder je korišten s ciljem sažimanja signala, tj. grafa pokrivenosti, i zatim je nad sažetim prikazom podataka obavljeno grupiranje. Korišeni su varijacijski i denoising autoencoder te algoritmi grupiranja k-means i spektralno grupiranje. Nađene grupe signala su vizualizirane te je provedena semantička analiza grupa. Procjenjena je kvaliteta klasifikacije signala korištenjem nenadziranog učenja. 
520 3 |a Sažetak na engleskom: During de novo genome assembly process, certain types of sequenced reads can cause problems during genome reconstruction. Goal of this thesis is to learn more about possible types of reads and classification of those reads using unsupervised learning. Coverage graphs of reads are generated using read overlaps and those coverage graphs are further analysed. Autoencoder is used to compress the signal, i.e. the coverage graph, and clustering algorithm is then applied to the compressed data. Variational and denoising autoencoders along with k-means and spectral clustering algorithms are used. Visualisation of found clusters is performed along with semantic analysis. Signal classification quality using unsupervised learning is estimated. 
653 1 |a bioinformatika  |a nenadzirano učenje  |a duboko učenje  |a autoenkoderi 
653 1 |a bioinformatics  |a unsupervised learning  |a deep learning  |a autoencoders 
700 1 |a Šikić, Mile  |4 ths 
942 |c Y 
999 |c 50336  |d 50336