Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona

Sažetak na hrvatskom: Metode izgradnje filogenetskog stabla temeljene na obilježjima taksona određuju međusobne odnose taksona, odnosno vrsta, promatrajući njihove morfološke ili molekularne razlike. Te metode daju preciznije rezultate od metoda temeljenih na udaljenostima taksona. Metoda najmanjeg...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:50996/Details
Glavni autor: Milisavljević, Alexandra (-)
Ostali autori: Domazet-Lošo, Mirjana (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, A. Milisavljević, 2019.
Predmet:
LEADER 02685na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2019 ci ||||| m||| 00| 0 hr d
035 |a (HR-ZaFER)ferid7215 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Milisavljević, Alexandra  |9 40272 
245 1 0 |a Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona :  |b završni rad /  |c Alexandra Milisavljević ; [mentor Mirjana Domazet-Lošo]. 
246 1 |a Phylogenetic Tree Construction using Maximum Parsimony and Maximum Likelihood  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b A. Milisavljević,  |c 2019. 
300 |a 35 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b preddiplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 41, datum predaje: 2019-06-14, datum završetka: 2019-07-12 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Metode izgradnje filogenetskog stabla temeljene na obilježjima taksona određuju međusobne odnose taksona, odnosno vrsta, promatrajući njihove morfološke ili molekularne razlike. Te metode daju preciznije rezultate od metoda temeljenih na udaljenostima taksona. Metoda najmanjeg broja evolucijskih promjena se vodi načelom Occamove oštrice, odnosno stablo koje zahtijeva najmanje promjena je najvjerojatnije da će se dogoditi. Druga metoda je metoda najveće izglednosti koja se temelji na probabilističkom modelu evolucije. Dodajući jedan po jedan takson u stablo se određuje koja topologija stabla je najizglednija. Nakon implementacije algoritama provedeno je testiranje na genomu virusa HIV-1 te su dobiveni rezultati uspoređeni s rezultatima već postojećih alata.  
520 3 |a Sažetak na engleskom: Characters based methods determine relations between taxons by evaluating their morphological or molecular differences. These methods give far better results than distance based methods. Maximum parsimony method follows the principle of Occam's razor, the tree that requires the least amount of changes is the most probable tree. The other method, maximum likelihood, is based on a probabilistic model of evolution. By adding taxons to the tree one by one, after each addition the most likely tree topology is recalculated. After the implementation of proposed algorithms, the tests were conducted using the genome of virus HIV-1, and the results were compared with ones gotten from existing phylogenetic tools.  
653 1 |a filogenetsko stablo  |a takson  |a metoda najmanjeg broja evolucijskih promjena  |a metoda najveće izglednosti 
653 1 |a phylogenetic tree  |a taxon  |a maximum parsimony  |a maximum likelihood 
700 1 |a Domazet-Lošo, Mirjana  |4 ths  |9 31117 
942 |c Z 
999 |c 50996  |d 50996