Poliranje DNA slijeda koristeći metode dubokog učenja

Sažetak na hrvatskom: Cilj ovog rada bio je implementirati model temeljen na dubokom uˇcenju koji bi pove´cao toˇcnost sastavljenog genoma. Konstruirani model temelji se na arhitekturi rezidualne neuronske mreže te postiže toˇcnost ve´cu od trenutno najboljih alata temeljenih na klasiˇcnom raˇcunars...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:51431/Details
Glavni autor: Vrček, Lovro (-)
Ostali autori: Šikić, Mile (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, L. Vrček, 2019.
Predmet:
LEADER 02037na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2019 ci ||||| m||| 00| 0 hr d
035 |a (HR-ZaFER)ferid7402 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Vrček, Lovro  |9 40716 
245 1 0 |a Poliranje DNA slijeda koristeći metode dubokog učenja :  |b završni rad /  |c Lovro Vrček ; [mentor Mile Šikić]. 
246 1 |a DNA Sequence Polishing Using Deep learning  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b L. Vrček,  |c 2019. 
300 |a 22 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b preddiplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 41, datum predaje: 2019-06-14, datum završetka: 2019-07-16 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Cilj ovog rada bio je implementirati model temeljen na dubokom uˇcenju koji bi pove´cao toˇcnost sastavljenog genoma. Konstruirani model temelji se na arhitekturi rezidualne neuronske mreže te postiže toˇcnost ve´cu od trenutno najboljih alata temeljenih na klasiˇcnom raˇcunarstvu, no zaostaje ne nadmašuje najbolje alate temeljene na dubokom ucˇenju. Med¯utim, zbog ogranicˇenja u vidu prostora za pohranu podataka i vremena treniranja modela, detaljnija analiza tek treba biti napravljena za više bakterijskih uzoraka i razliˇcite arhitekture mreže. 
520 3 |a Sažetak na engleskom: Goal of this work was to implement a deep learning model in order to increase the accuracy of the assembled genome. This model is based on a residual network architecture and achieves higher accuracy than classical state-of-the-art tools, but falls behind the best deep-learning tools available. However, due to limitations in terms of storage and time for training the model, further analysis has to be conducted for different bacteria datasets and network architectures. 
653 1 |a sastavljanje genoma, konsenzus, duboko učenje 
653 1 |a genome assembly, consensus, deep learning 
700 1 |a Šikić, Mile  |4 ths  |9 29535 
942 |c Z 
999 |c 51431  |d 51431