|
|
|
|
| LEADER |
02127na a2200229 4500 |
| 003 |
HR-ZaFER |
| 008 |
160221s2016 ci ||||| m||| 00| 0 en d |
| 035 |
|
|
|a (HR-ZaFER)ferid2721
|
| 040 |
|
|
|a HR-ZaFER
|b hrv
|c HR-ZaFER
|e ppiak
|
| 100 |
1 |
|
|a Kostelac, Mario
|9 40983
|
| 245 |
1 |
0 |
|a De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom :
|b diplomski rad /
|c Mario Kostelac ; [mentor Mile Šikić].
|
| 246 |
1 |
|
|a De Novo Assembly Using Long Error-prone Reads
|i Naslov na engleskom:
|
| 260 |
|
|
|a Zagreb,
|b M. Kostelac,
|c 2016.
|
| 300 |
|
|
|a 51 str. ;
|c 30 cm +
|e CD-ROM
|
| 502 |
|
|
|b diplomski studij
|c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu
|g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 56, datum predaje: 2016-02-12, datum završetka: 2016-02-15
|
| 520 |
3 |
|
|a Sažetak na hrvatskom: Sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom (bez ispravljanja očitanja) je obećavajuća metoda. Diplomski rad pokazuje da se, ako se koriste zajedno s jednostavnim metodama za uklanjanje šuma iz podataka, metode korištene za sastavljanje genoma koristeći kratka očitanja mogu koristiti i za sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja. Implementirane metode su testirane na dva skupa podataka E. coli (jedan tvrtke PacBio i jedan tvrtke Oxford Nanopore Technologies). Rezultati su uspoređeni s rezultatima miniasm assemblera.
|
| 520 |
3 |
|
|a Sažetak na engleskom: Assembling genomes from long error-prone reads without error correction seems like a promising method. The thesis shows that layout methods used for assembling genomes from short reads can be utilized for assembling from long error-prone reads, if coupled with new methods for eliminating the noise from a dataset. Methods are validated with two datasets of Escherichia coli (PacBio and Oxford Nanopore Technologies). Results are compared with results of the miniasm assembler.
|
| 653 |
|
1 |
|a De novo sastavljanje genoma, PacBio, Oxford Nanopore technologies, faza razmještaja
|
| 653 |
|
1 |
|a De novo assembly, PacBio, Oxford Nanopore Technologies, layout
|
| 700 |
1 |
|
|a Šikić, Mile
|4 ths
|9 29535
|
| 942 |
|
|
|c Y
|
| 999 |
|
|
|c 51693
|d 51693
|