|
|
|
|
| LEADER |
02217na a2200229 4500 |
| 003 |
HR-ZaFER |
| 008 |
160221s2018 ci ||||| m||| 00| 0 en d |
| 035 |
|
|
|a (HR-ZaFER)ferid5456
|
| 040 |
|
|
|a HR-ZaFER
|b hrv
|c HR-ZaFER
|e ppiak
|
| 100 |
1 |
|
|a Škugor, Luka
|
| 245 |
1 |
0 |
|a De novo sastavljanje metagenoma koristeći metode za grupiranje očitanja :
|b diplomski rad /
|c Luka Škugor ; [mentor Mile Šikić].
|
| 246 |
1 |
|
|a De Novo Metagenome Assembly Using Read Clustering
|i Naslov na engleskom:
|
| 260 |
|
|
|a Zagreb,
|b L. Škugor,
|c 2018.
|
| 300 |
|
|
|a 28 str. ;
|c 30 cm +
|e CD-ROM
|
| 502 |
|
|
|b diplomski studij
|c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu
|g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 56, datum predaje: 2018-06-29, datum završetka: 2018-07-05
|
| 520 |
3 |
|
|a Sažetak na hrvatskom: Kod metagenomskog sastavljanja, suočeni smo s mnogim dodatnim izazovima u odnosu na sastavljanje jednog genoma.
U ovom radu, pokušali smo riješiti ove probleme grupiranjem segmenata koje proizvode alati treće generacije za sekvenciranje.
U idealnom slučaju, to bi omogućilo korištenje postojećih de novo alata za sastavljanje genoma na metagenomskom uzorku.
Naša implementacija grupiranja je donekle poboljšala postojeće alate za de novo sastavljanje kod primjene na metagenomskom uzorku, no još uvijek su potrebna daljnja istraživanja.
Izvorni kod rješenja dostupan je na adresi https://github.com/lukadante/rala-cluster.
|
| 520 |
3 |
|
|a Sažetak na engleskom: Metagenomic assembly poses many additional challenges over single genome assembly.
In this work, we tried tackling these issues by clustering reads produced by third-generation sequencing tools.
In an ideal case, this would allow the use of existing de novo assembly tools for single genome assembly on metagenomic input.
Our clustering implementation showed some improvement of existing tools for de novo assembly when using them for metagenome assembly, but still requires a lot of research.
The source code of the solution is available at https://github.com/lukadante/rala-cluster.
|
| 653 |
|
1 |
|a metagenomsko sastavljanje
|a grupiranje
|a DNA
|
| 653 |
|
1 |
|a metagenome assembly
|a clustering
|a DNA
|
| 700 |
1 |
|
|a Šikić, Mile
|4 ths
|
| 942 |
|
|
|c Y
|
| 999 |
|
|
|c 50191
|d 50191
|