Alat za globalno poravnavanje sekvenci

Sažetak na hrvatskom: Ovaj rad predlaže bioinformatički alat za poravnavanje cijelog genoma. Dano je detaljno objašnjenje algoritma te usporedba s drugim renomiranim alatima koji rješavaju slični problem poput MUMmer-a i BLASR-a. Dobiveni algoritam se pokazao kao vrlo efikasan, usporediv s alatom MU...

Full description

Permalink: http://skupni.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:50550/Details
Glavni autor: Žužić, Goran (-)
Ostali autori: Šikić, Mile (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, G. Žužić, 2015.
Predmet:
LEADER 01675na a2200229 4500
003 HR-ZaFER
008 160221s2015 ci ||||| m||| 00| 0 en d
035 |a (HR-ZaFER)ferid4587 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Žužić, Goran 
245 1 0 |a Alat za globalno poravnavanje sekvenci :  |b diplomski rad /  |c Goran Žužić ; [mentor Mile Šikić]. 
246 1 |a Global sequence alignment tool  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b G. Žužić,  |c 2015. 
300 |a 28 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b diplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 56, datum predaje: 2015-02-06, datum završetka: 2015-02-16 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Ovaj rad predlaže bioinformatički alat za poravnavanje cijelog genoma. Dano je detaljno objašnjenje algoritma te usporedba s drugim renomiranim alatima koji rješavaju slični problem poput MUMmer-a i BLASR-a. Dobiveni algoritam se pokazao kao vrlo efikasan, usporediv s alatom MUMmer, iako uz manju mjeru osjetljivosti.  
520 3 |a Sažetak na engleskom: This thesis proposes a bioinformatics tool that can be used for whole genome alignment. A detailed description of the algorithm is provided and compared to well-established tools like MUMmer and BLASR. The algorithm proves to be highly efficient, comparable to MUMmer, although with lower sensitivity.  
653 1 |a bioinformatika  |a poravnanje sekvenci  |a sufiksni nizovi  |a LCSk++  |a rijetko dinamičko programiranje 
653 1 |a bioinformatics  |a sequence alignment  |a suffix arrays  |a LCSk++  |a sparse dynamic programming 
700 1 |a Šikić, Mile  |4 ths 
942 |c Y 
999 |c 50550  |d 50550